Shrek ve Fiona, krallığın yönetimini üstlendikleri bu yeni hayatlarında hiç de hayal ettikleri huzuru bulamazlar. Yönetimle gelen zorluklar ve sorumluluklar, onların sevdiği basit bataklık yaşamından oldukça uzaktır. Shrek, kral olmanın ona hiç uygun olmadığını hisseder ve tahtın gerçek sahibini bulup görevini devretmeye karar verir. Bu görev, Fiona’nın kuzeni olan genç ve deneyimsiz Artus’u bulmayı gerektirir.
Shrek, Eşek ve Çizmeli Kedi, Artus’u bulmak ve onu krallığın başına geçmeye ikna etmek için uzun bir yolculuğa çıkarlar. Ancak, bu süreçte Artus’un kendine olan güvensizliği ve sorumluluk almaktan kaçınması işleri daha da zorlaştırır. Shrek’in hem Artus’a hem de kendine liderlik hakkında bir şeyler öğretmesi gereken bu macera, bir yandan kahkaha dolu anlarla, bir yandan da samimi duygusal karşılaşmalarla doludur.
Bu sırada, Fiona krallıkta kalmış ve Shrek’in yokluğunda zorluklarla yüzleşmektedir. Prens Charming, tahtı ele geçirmek ve kendi hayalini gerçekleştirmek için fırsat kollamaktadır. Fiona, krallığın kadınlarını da yanına alarak Charming’in planlarına karşı bir direniş örgütler. Fiona ve arkadaşları, güçlerini birleştirerek krallığı korumak için cesaretle mücadele ederler.
Hem Shrek’in hem de Fiona’nın ayrı ayrı verdikleri mücadeleler, onların birlikte oluşturdukları aileyi ve bağlılıklarını yeniden keşfetmelerine olanak tanır. Komik olayların, zorlu engellerin ve dokunaklı anların eşlik ettiği bu hikâye, sorumluluk almanın ve sevdikleriniz için mücadele etmenin önemini vurgular. Shrek ve Fiona, bu zorlu süreçte huzurun ve mutluluğun sadece yaşam tarzında değil, sevdiklerinizle birlikte olduğunuz her anın içinde saklı olduğunu fark ederler.